مرکز تحقیقات سلول و ژن درمانی کودکان (در ابتدا مرکز تحقیقات سلول درمانی کودکان نامیده می شد) در جهت پیشبرد پژوهش و فناوری درحوزه‌ی سلول‌های بنیادی و پزشکی بازساختی در سال ۱۳۹۸ راه اندازی شده است. این مرکز در بیمارستان مرکز طبی، قطب علمی کودکان کشور واقع شده است و از جمله مراکز تحقیقاتی وابسته به دانشگاه علوم پزشکی تهران می‌باشد. هدف اصلی این مرکز فعالیت در حوزه‌ی ژن درمانی و سلول درمانی می‌باشد. این مرکز از سال ۱۳۹۵ از طرف انجمن پیوند سلول‌های بنیادی خونساز اروپا (EBMT) به عنوان مرکز همکار کامل (Full member) شناخته شده است.